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RESOURCES Automation Chemical Characterization Strain collection

AUTOMATION

Pipeting robots

Hamilton STARlet 8-Canal:
Liquid handling and assay assembly; equipped with Easypick automated Colony picker for selection of microorganisms.

Hamilton STARlet 96-Canal:
amplification and inoculation and additionally equipped with a unique Pin Tool for inoculation of up to 1536 colonies on solid medium

High Throughput growth and enzyme assays with incubation:
Cytomat 2c 450, 42 standard microtiter plates (4°C – 50°C)
Hamilton Rackrunner for plate transport between machines

2 Plate readers:
BioTek Synergy H1 with monochromator UV-Vis absorbance and luminescence detection and injection module

CHEMICAL CHARACTERIZATION

Flash chromatography puriFlash 450 system for bulk purifications

HPLC systems:
Agilent 1200, Diode Array Detector (DAD) and fraction collector (fraction volume 300 ul to 5mL)
Preparative HPLC system: Agilent 1260, Infinity Diode Array Detector (DAD) and fraction collector (fraction volumes either 14ml or 50mL)

Powerful and universal detector:
Corona Charged Aerosol Detector Veo RS CAD can be coupled to the analytical and preparative HPLC system.
Access to LC-MS Orbitrap (iBAM, IFA) and 400MHz NMR (DCH, BOKU)

STRAIN COLLECTION

The sequencing of microbial genomes predicts a much higher variety of microbial metabolites than previously assumed. This has recently lead researchers to focus on the potential exploitation of microbial genetic resources. Therefore, we have built and are continuously expanding our strain collection of fungi and bacteria. Most samples come from soil with also a significant collection of Candida species obtained from Austrian sources. Our approach searches and characterizes previously unknown bioactive compounds and enzymes from bacteria, fungi and other microorganisms. By mimicking natural conditions, biotic interactions between different organisms in different chemical and physical environments are possible. This promotes the production of specific metabolites.

ADDITIONAL EQUIPMENT

High throughput cell lysis (MP96), various fermentation Chambers, Incubators (also CO2), 2 clean benches, 5 bench places, 4 fume hoods, -80 freezer, CLSM and other Microscopes, Rotavapor and more. The Labs are BSL2 certified.

If you are interested and would like more information – just get in contact with us: office@bimm-research.at

Three novel bioactive compounds

Chemical composition of anti-microbially active fractions derived from extract of filamentous fungus Keratinophyton Lemmensii including three novel bioactive compounds
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New regulation hub identified

KdmB-EcoA-RpdA-SntB chromatin complex binds regulatory genes
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We dig into the genetic network that transmits an external starvation signal

RimO (SrrB) is required for carbon starvation signaling
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How to Completely Squeeze a Fungus

Advanced Genome Mining Tools for Novel Bioactive Substances
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Streptomyces–Aspergillus interaction

Polaramycin B is the signal that rewires fungal metabolism in the Streptomyces–Aspergillus interaction
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Multidrug resistance

We shed light on the mutational paths leading to resistance and cross-resistance to antifungal drugs.
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BiMM Bioactive Microbial Metabolites

Universitäts- & Forschungszentrum Tulln

Konrad-Lorenz-Straße 24

A-3430 Tulln

Austria

T +43 1 47654 94484

office@bimm-research.at

PROJECT LEAD


Universität für Bodenkultur Wien

Department of Agricultural Sciences

Institute of Microbial Genetics

PROJECT PARTNER

Veterinärmedizinische Universität Wien

Institute of Food Safety, Food Technology and Veterinary Public Health

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